بخش هاي اصلي سايت عبارتند از:
۱- معرفي پژوهشگاه
تكامل روند تأسيس- ساختار تشكيلاتي- اهداف و وظايف پژوهشگاه- عملكرد وضعيت نيروي انساني
۲- پژوهشكده زلزله شناسي
وظايف كلان پژوهشگاه عبارتند از:
* مطالعات و تحقيقات جامع تحليلي، تجربي، صحرايي و دستگاهي با هدف شناخت بهتر و دقيق تر چشمه هاي لرزه اي(گلسها)، پوسته ايران زمين، لرزه خيزي، خطر زمين لرزه، پهنه بندي، تهيه انواع نقشه هاي مربوطه و تدوين كاتالوگ داده هاي زلزله
* ايجاد، توسعه و بهبود شبكه ملي لرزه نگاري باند پهن كشور و ديگر شبكه هاي لرزه نگاري و شتابنگاري براي فرابيني و شناخت بهتر و دقيق تر فعاليتهاي لرزه اي ايران و منطقه.
* (NDC) انجام كليه امور مربوط به نظارت لرزه اي و همچنين مركز ملي داده هاي ايران وابسته به معاهده جامعه منع آزمايشهاي هسته اي.
* طراحي و ساخت تجهيزات ايستگاه هاي لرزه نگاري و تجهيزات اندازه گيري هاي صحرايي
* برگزاري دوره دكتراي ژئوفيزيك با گرايش زلزله شناسي
* اطلاع رساني دقيق و جامع فعاليت لرزه اي ايران و جهان
* ارائه خدمات فني و مشاوره اي در زمينه فعاليتهاي پژوهشكده
همكاري پژوهشي و فناوري با مراكز تحقيقاتي و آموزش داخلي و سازمانهاي ملي و بين المللي
۳- پژوهشكده مهندسي ژئوتكنيك:
پژوهشكده مهندسي ژئوتكنيك با برنامه ها و وظايف زير تشكيل شده.
* مطالعات و تحقيقات جامع تحليلي، تجربي، كاربردي، صحرايي و دستگاهي در زمينه هاي روانگرايي، زمين لغزه، تأثيرات ساختگاه در حركت قوي زمين، اندركنش خاك و سازه  پهنه بندي و ريز پهنه بندي ژئوتكنيكي و تهيه نقشه هاي مرتبط:
* مطالعات و تحقيقات نظري به منظور نوآوري و توسعه در روشهاي تحليل و طراحي مكانيك خاك و مهندسي پي با تأكيد بر بارگذاريهاي ديناميكي در زمينه هاي مدلهاي رفتاري، مكانيك خاك محيط هاي متخلخل چندفازه، رفتار ابنيه خاكي و موارد مشابه؛ شناسايي شرايط ساختگاهي به منظور آگاهي از طبيعت رفتار خاك و تعيين مشخصات فيزيكي و مكانيكي آن براي مدلسازي لايه هاي خاك و تحليل پاسخ لرزه اي ساختگاه؛ بررسي ناپايداريهاي ژئوتكينكي شامل ارزيابي پتانسيل لغزش زمين در شيب هاي طبيعي، مصنوعي، ترانشه ها و ارزيابي پتانسيل  روانگرايي خاكها؛
* ارزيابي ظرفيت باربري، نشست و تغيير شكل پي هاي سطحي و پي هاي عميق و ارزيابي اندركنش خاك- پي- سازه؛
* ارزيابي رفتار ابنيه خاكي مانند سدهاي خاكي و سنگريزه اي و ابنيه نگهبان مانند ديوارهاي حائل؛
* ايجاد، توسعه و بهبود امكانات آزمايشگاهي ثابت و صحرايي و ساخت تجهيزات آزمايشگاهي و صحرايي در زمينه هاي تحقيقاتي مرتبط؛
* همكاري با صنعت، سازمانهاي اجرايي و جامعه مهندسي كشور از طريق ارائه خدمات مشاوره  اي؛
* برگزاري دوره دكتراي مهندسي عمران- زلزله(ژئوتكنيك)
* ارزيابي رفتار ابنيه خاكي مانند سدهاي خاكي و سنگريزه اي و ابنيه نگهبان مانند ديوارهاي حائل؛
* ايجاد، توسعه و بهبود امكانات آزمايشگاهي ثابت و صحرايي و ساخت تجهيزات آزمايشگاهي و صحرايي در زمينه هاي تحقيقاتي مرتبط؛
* همكاري با صنعت، سازمانهاي اجرايي و جامعه مهندس كشور از طريق ارائه خدمات مشاوره اي؛
* برگزاري دوره دكتراي مهندسي عمران- زلزله(ژئوتكنيك)؛
* همكاري علمي- پژوهشي و فناوري با مراكز تحقيقاتي، آموزشي، انجمن ها و سازمانهاي داخلي و خارجي.
۴- پژوهشكده سازه 
پژوهشكده مهندسي سازه با برنامه ها و وظايف زير در پژوهشگاه ايجاد شده است:
* مطالعات و تحقيقات جامع تحليلي، تجربي، ميداني و دستگاهي ايمن سازي لرزه اي ساخت و سازها(ساختمان ها، شريانهاي حياتي، سازه هاي نيروگاهي و صنعتي، تأسيسات مهم مانند سدها، پل ها، مخازن و مشابه آنها)؛
* گسترش روشهاي طراحي لرزه اي ساخت ابنيه جديد، مقاوم سازي ساختمانهاي موجود در برابر زلزله و تدوين آيين نامه و دستور العمل مربوطه؛
* توسعه فناوري جديد ساختماني براي توليد نيمه صنعتي ساختمانهاي مقاوم در برابر زلزله؛
* تحليل آسيب پذيري شهرها و روستاها، تدوين روشهاي كاهش آسيب پذيري و كمك به اجزاي آن؛ 
* مطالعه و ارائه مناسب اقتصادي و اجرايي براي كاهش آثار مخرب زلزله  در بناها؛
* هماهنگ سازي آخرين دستاوردهاي علمي و فني در مورد طراحي و مقاوم سازي كليه مستحدثات موجود در كشور؛
* ايجاد، توسعه و بهبود امكانات آزمايشگاهي، تجهيزات اندازه گيري و نصب وسايل اندازه گيري در سازه هاي مهم؛
* همكاري با صنعت، سازمانهاي اجرايي و جامعه مهندسي كشور از طريق ارائه خدمات مشاوره اي؛
* برگزاري دوره دكتراي مهندسي عمران- زلزله(سازه )؛
* همكاريهاي علمي- پژوهشي و فناوري با مراكز تحقيقاتي- آموزشي و انجمن هاي علمي و مهندسي داخل و خارج از كشور؛
۵- مديريت بحران
چرخه بحران (پيشگيري- كاهش و كنترل آثار- آمادگي- پاسخگويي- امدادرساني- بهبود و توسعه) از عناصر اصلي سياستگذاري ملي مديريت خطرپذيري در هر كشور مي باشد- بخش مديريت خطرپذيري فعاليتهاي خود را در قالب گروه هاي آموزش همگاني- برنامه ريزي شهري- مطالعات اقتصادي، اجتماعي و فرهنگي سازماندهي نموده است. اين بخش در آينده تبديل به پژوهشكده مديريت خطرپذيري خواهد شد.
۶- تحصيلات تكميلي
پژوهشگاه با هدف گسترش دانش علوم و فنون مربوط به زلزله و تربيت نيروهاي متخصص اقدام به برگزاري دوره هاي كارشناسي ارشد مهندسي عمران- مهندسي زلزله، دكتراي مهندسي عمران- مهندسي زلزله و دكتراي ژئوفيزيك- زلزله شناسي نموده است. همچنين دوره هاي كوتاه مدت تخصصي از ديگر برنامه هاي پژوهشگاه مي باشد.
اطلاعات دوره ها- انجمن دانش آموختگان پژوهشگاه- برنامه هاي آينده- چكيده پايان نامه ها و عناوين سمينارها در اين بخش قابل دسترسي است.
۷- كتابخانه و مركز اسناد
در اين بخش سه فعاليت عمده گردآوري- سازماندهي و اشاعه اطلاعات انجام مي گيرد كه كل اين فعاليتها در ۳ بخش سفارشات- خدمات فني و امانت قابل اجرا است.
۸- انتشارات
مركز انتشارات پژوهشگاه تاكنون با نشر ۱۶۰ گزارش تحقيقاتي، ۴۳ جلد كتاب و ۶۲ جلد مجله علمي به زبان فارسي و انگليسي سهم بسزايي در گسترش دانش زلزله در كشور ايفا نموده است.
انتشار فصلنامه پژوهشنامه زلزله شناسي و مهندسي زلزله به زبان فارسي از سال ۱۳۷۱ و انتشار فصلنامه، ژورنال زلزله شناسي و مهندسي زلزله (JSSE) به زبان انگليسي از سال ۱۳۷۸ از خروجي هاي اين بخش محسوب مي شود.
۹- آموزش همگاني
شامل معرفي- توصيه هاي ايمني- اخبار- افسانه هاي زلزله جهان- سايتهاي مرتبط و جهان لرزه خيز است.
۱۰- كنفرانسهاي بين المللي
۱۱- زمين لرزه هاي اخير
۱۲- بانك داده ها
۱۳- خبرهاي پژوهشكده
* اطلاع رساني سايت به ۲ زبان فارسي- انگليسي است و براي مشاهده صفحات فارسي بايد ۱۰ قلم استفاده شده در سايت را به صورت يك فايل فشرده EXE از سايت Download و نصب كرد. تاريخ به روز رساني در صفحه اول نشان دهنده پويا بودن سايت به صورت هفتگي است، براي مشاهده HomePage به صورت كامل بايد مد نمايش را در حالت ۷۶۸*۱۰۲۴ قرار داد.